2010年2月，农业部科技发展中心通报了2009年35个参加农业部部级农业转基因生物安全中心能力测试评定结果，我院参加测试的8个转基因质检中心在测试中准确检出所有样品的全部参数，均获得能力评定“满意”结果。
　　为了更好地发挥农业转基因生物安全检测中心的技术支撑作用，强化已通过认证评审的部级农业转基因生物安全检测中心的能力建设和规范化管理，农业部科技教育司和农产品质量安全监管局有针对性地开展了这一次能力验证活动，由农业部科技发展中心具体组织实施。根据《2009年农业部农业转基因生物安全检测机构能力测试实施方案》，农业部科技发展中心统一制备测试样品，要求参试中心在规定时间内提交样品检测结果，组织有关专家进行汇总分析，并按照实施方案中“结果判定与能力评级”的规定评定，参试的35个中心有33个检测能力被评为“满意”，其中我院农业部转基因植物环境安全监督检验测试中心（植保所）、农业部转基因植物用微生物环境安全监督检验测试中心（生物所）、农业部转基因生物生态环境安全监督检验测试中心（环保所）、农业部转基因植物环境安全监督检验测试中心（水稻所）、农业部转基因植物环境安全监督检验测试中心（棉花所）、农业部转基因植物环境安全监督检验测试中心（油料所）、农业部转基因烟草环境安全监督检验测试中心（烟草所）、农业部转基因动物及饲料安全监督检验测试中心（畜牧兽医所）等8个参试中心均获得“满意”结果。
　　我院非常重视转基因质检中心的建设与管理工作，2008年积极推进8个转基因质检中心完成了认证评审，2009年9月在武汉组织召开了全院质检中心建设与管理现场观摩会，各质检中心就建设与管理工作进行了广泛的交流、学习，参观了各项工作走在前列的农业部油料及制品质量监督检验测试中心，还专门邀请了农业部主管领导到会指导，有力地推动了全院质检中心的建设与发展。一年多来，我院转基因质检中心在相关法律法规调研、标准制定、执法检查、国际交流与合作、检测技术培训等方面发挥了重要作用，为农业部农业转基因生物安全管理提供了重要技术支撑。